可与先进蛋白力场媲美的RNA力场
引言
长时间的分子动力学(MD)模拟在研究蛋白构象变化中非常成功。原则上,MD模拟对于研究RNA分子的构象变化同样应该是一个强大的工具。然而,RNA的物理模型精确性相比蛋白模型精确度较低,甚至在简单的RNA体系中都需要人工矫正来提升RNA力场的精确性,这限制了其应用。提高RNA力场的精确性将极大地促进MD模拟用于研究具有生物意义的RNA分子相关的动力学。
长时间的分子动力学(MD)模拟在研究蛋白构象变化中非常成功。原则上,MD模拟对于研究RNA分子的构象变化同样应该是一个强大的工具。然而,RNA的物理模型精确性相比蛋白模型精确度较低,甚至在简单的RNA体系中都需要人工矫正来提升RNA力场的精确性,这限制了其应用。提高RNA力场的精确性将极大地促进MD模拟用于研究具有生物意义的RNA分子相关的动力学。