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蛋白设计

AlphaFold3学习笔记

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2024-12-26

RFdiffusion学习笔记

RFdiffusion学习笔记 RFdiffusion介绍 TODO RFdiffusion安装 1. 安装准备工作 git下载: git clone https://github.com/RosettaCommons/RFdiffusion.git 进入目录并下载模型的weights: cd R
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2024-11-20

dl_binder_design学习笔记

dl_binder_design 由于文章我已经看过几次了,这里只是简单进行记录dl_binder_desgin的计算 快速安装 1.准备工作 假设已经安装好CUDA 12.1和MiniConda ,具体方法可以查看网络上的相关教程,非常简单。 克隆最新代码 git clone https://
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2024-11-19

BindCraft学习笔记

BinderCraft是一款出色的Binder设计工具,其主要的思路为利用AF2的反向传播来生成新的binder,其具有较高的准确度,无需生成大批量的样本用于筛选。 BinderCraft特点 可以自动判断hotspots Binder和target可以进行动态的模拟 使用MPNN SOL 来解决溶
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2024-11-17